La Direzione Generale sovrintende all'attività sanitaria militare e alle seguenti attività: - ricerca scientifica e pubblicistica sanitaria militare;
- medicina preventiva e sociale;
- contenzioso in materia sanitaria;
- servizio trasfusionale militare;
- medicina curativa e riabilitativa;
- medicina legale;
- psicologia militare e statistica sanitaria.
Relativamente ai materiali sanitari e farmaceutici, Difesan è responsabile di:
- studio e sviluppo tecnico;
- costruzione, produzione, approvvigionamento, trasformazione, distribuzione e conservazione;
- manutenzione, riparazione, revisione recupero e alienazione;
- emanazione della relativa normativa tecnica.
Sovrintende, inoltre, alla formazione, quando effettuata presso gli organi e gli stabilimenti dipendenti, di personale tecnico e specializzato militare e civile per le unità operative e per gli organi addestrativi, logistici e territoriali.
L'organico della Direzione Generale ammonta a complessive 116 unità (38 militari e 78 civili). A differenza delle altre Direzioni Generali, Difesan non è stata sottoposta al processo di riordino conseguente alla legge sui vertici militari. Il riordino è stato rinviato al più complessivo riordino della Sanità Militare, in itinere e all'esame della attuale Legislatura.